Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tuba8Q9JJZ2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms