Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms