Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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