Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rhox9Q9EQM5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms