Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Swt1Q9DBQ9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Swt1Q9DBQ9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Swt1Q9DBQ9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Swt1Q9DBQ9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Swt1Q9DBQ9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Swt1Q9DBQ9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms