Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Wdr53Q9DB94 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Wdr53Q9DB94 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Wdr53Q9DB94 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Wdr53Q9DB94 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Wdr53Q9DB94 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Wdr53Q9DB94 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Wdr53Q9DB94 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Wdr53Q9DB94 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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