Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V3

Echdc1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc1Q9D9V3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc1Q9D9V3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms