Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms