Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms