Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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