Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pus10Q9D3U0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms