Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Lamp5Q9D387 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Lamp5Q9D387 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Lamp5Q9D387 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Lamp5Q9D387 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Lamp5Q9D387 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Lamp5Q9D387 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Lamp5Q9D387 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lamp5Q9D387 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms