Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Trappc6bQ9D289 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Trappc6bQ9D289 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Trappc6bQ9D289 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Trappc6bQ9D289 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Trappc6bQ9D289 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Trappc6bQ9D289 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Trappc6bQ9D289 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Trappc6bQ9D289 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Trappc6bQ9D289 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Trappc6bQ9D289 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Trappc6bQ9D289 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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