Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan11Q9D1D1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tspan11Q9D1D1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Tspan11Q9D1D1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan11Q9D1D1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan11Q9D1D1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan11Q9D1D1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan11Q9D1D1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan11Q9D1D1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan11Q9D1D1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan11Q9D1D1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan11Q9D1D1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Tspan11Q9D1D1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms