Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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