Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ifitm3Q9CQW9 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms