Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms