Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TpbpbQ9CQC0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms