Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms