Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms