Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms