Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms