Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms