Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4cQ8VCD7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4cQ8VCD7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms