Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GcaQ8VC88 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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