Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top1mtQ8R4U6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top1mtQ8R4U6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top1mtQ8R4U6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top1mtQ8R4U6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top1mtQ8R4U6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Top1mtQ8R4U6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Top1mtQ8R4U6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Top1mtQ8R4U6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Top1mtQ8R4U6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Top1mtQ8R4U6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Top1mtQ8R4U6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Top1mtQ8R4U6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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