Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11fip5Q8R361 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms