Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Trappc12Q8K2L8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Trappc12Q8K2L8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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Trappc12Q8K2L8 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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Trappc12Q8K2L8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Trappc12Q8K2L8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Trappc12Q8K2L8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Trappc12Q8K2L8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Trappc12Q8K2L8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Trappc12Q8K2L8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc12Q8K2L8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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