Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip3Q8CHD8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip3Q8CHD8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip3Q8CHD8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip3Q8CHD8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rab11fip3Q8CHD8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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