Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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