Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ufl1Q8CCJ3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ufl1Q8CCJ3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ufl1Q8CCJ3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms