Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ccdc186Q8C9S4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc186Q8C9S4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc186Q8C9S4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc186Q8C9S4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc186Q8C9S4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc186Q8C9S4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc186Q8C9S4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc186Q8C9S4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc186Q8C9S4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc186Q8C9S4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms