Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TnrQ8BYI9 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TnrQ8BYI9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TnrQ8BYI9 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TnrQ8BYI9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TnrQ8BYI9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TnrQ8BYI9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TnrQ8BYI9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TnrQ8BYI9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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