Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms