Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms