Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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