Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms