Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Clec18aQ7TSQ1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms