Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Dsg1bQ7TSF1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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