Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms