Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms