Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Timd4Q6U7R4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Timd4Q6U7R4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Timd4Q6U7R4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Timd4Q6U7R4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.4 ms