Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vstm2lQ6PDS0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms