Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms