Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp49Q6P9L4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp49Q6P9L4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp49Q6P9L4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp49Q6P9L4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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