Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Krt77Q6IFZ6 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Krt77Q6IFZ6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Krt77Q6IFZ6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Krt77Q6IFZ6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Krt77Q6IFZ6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Krt77Q6IFZ6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Krt77Q6IFZ6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Krt77Q6IFZ6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Krt77Q6IFZ6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Krt77Q6IFZ6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Krt77Q6IFZ6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Krt77Q6IFZ6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Krt77Q6IFZ6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Krt77Q6IFZ6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Krt77Q6IFZ6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Krt77Q6IFZ6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Krt77Q6IFZ6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Krt77Q6IFZ6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Krt77Q6IFZ6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt77Q6IFZ6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms