Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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