Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms