Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kiaa1549Q68FD9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms