Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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PtprdQ64487 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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PtprdQ64487 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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PtprdQ64487 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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PtprdQ64487 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprdQ64487 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprdQ64487 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprdQ64487 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprdQ64487 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprdQ64487 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprdQ64487 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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